Não há necessidade de separar, a menos que você queira um produto realmente puro, mas dessa forma você perde grande parte da base presa entre as moléculas de água.
Sem ebulição, o tolueno ferve a 110 °C, e a essa temperatura no ar você destrói a base rapidamente. Basta basificar sobre gelo para que a massa da reação permaneça abaixo de 60 °C, de preferência o mais frio possível, extrair 2 a 3 vezes com o que tiver, secar, precipitar ou, alternativamente, evaporar algum solvente sob vácuo e diluir com acetona.
Sem ebulição, o tolueno ferve a 110 °C, e a essa temperatura no ar você destrói a base rapidamente. Basta basificar sobre gelo para que a massa da reação permaneça abaixo de 60 °C, de preferência o mais frio possível, extrair 2 a 3 vezes com o que tiver, secar, precipitar ou, alternativamente, evaporar algum solvente sob vácuo e diluir com acetona.